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1.
Rev. cuba. med. trop ; 74(2): e768, May.-Aug. 2022. graf
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1408905

ABSTRACT

Introducción: La coinfección del virus de inmunodeficiencia humana (VIH) y la tuberculosis ha alterado su presentación histológica, esto es particularmente frecuente en las linfadenitis. Objetivos: Realizar la caracterización etiológica de linfadenopatías producidas por el género Mycobacterium, destacar la importancia del diagnóstico precoz de esta enfermedad para evitar diseminación de la infección, tanto en pacientes inmunocompetentes como inmunodeficientes, específicamente con VIH/sida. Método: Se realizó estudio descriptivo-prospectivo entre enero de 2017 y enero de 2019. Durante este período se recibieron 5640 muestras, de estas 81 obtenidas a partir de tejido ganglionar; la toma de muestra mayoritariamente fue quirúrgica 74 (91,35 por ciento) y 7 (8,64 por ciento) por biopsia aspirativa (BAAF). Del total de muestras, 60 (74,07 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida, las muestras se descontaminaron por el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, se cultivaron en medio sólido Löwenstein-Jensen e incubaron a 37°C. Se realizaron lecturas semanalmente. Para identificar Mycobacterium tuberculosis se realizó la prueba rápida comercial inmunocromatográfica SD TB AgMPT64. Resultados: De 81 muestras analizadas se obtuvieron 22 (27,16 por ciento) aislamientos, 16 (72,72 por ciento) de Mycobacterium tuberculosis, y 6 (27,27 por ciento) de especies no tuberculosas. De estas, 18 (81,81 por ciento) procedían de pacientes con VIH/sida. Conclusión: Por todo lo antes expuesto es importante la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extrapulmonar, tanto para M. tuberculosis como para otras especies no tuberculosas y poder comenzar tempranamente el tratamiento específico evitando la diseminación de la infección, pues esta puede tener consecuencias fatales, sobre todo en pacientes con algún tipo de inmunosupresión, como aquellos con VHI/sida. Si un paciente mantiene fiebre prolongada, con linfadenopatías, sin síntomas respiratorios y no responde a los tratamientos con antibióticos, es necesario pensar en este tipo de infección(AU)


Introduction: The coinfection of human immunodeficiency virus (HIV) and tuberculosis has altered its histological presentation; this is particularly frequent in lymphadenitis. Objective: To carry out the etiological characterization of lymphadenopathies produced by the genus Mycobacterium, highlighting the importance of early diagnosis of this disease to avoid dissemination of the infection, both in immunocompetent and immunodeficient patients, specifically HIV / AIDS. Methods: A descriptive-prospective study was carried out between January 2017 - January 2019. During this period, 5640 samples were received, of these 81 obtained from lymph node tissue, the sample collection was mostly surgical 74 (91.35 percent) and 7 (8.64 percent) by aspiration biopsy (BAAF). Of the total samples, 60 (74.07 percent) were from HIV / AIDS patients, the samples were decontaminated by the 4 percent sulfuric acid method and cultured in solid Löwenstein-Jensen medium and incubated at 370C, the readings were made weekly. For the identification of Mycobacterium tuberculosis, the commercial SD TB AgMPT64 immunochromatographic rapid test was performed. Results: Of 81 samples analyzed, 22 (27.16 percent) isolates were obtained, 16 (72.72 percent) of Mycobacterium tuberculosis (MTB), and 6 (27.27 percent) of non-tuberculous species, of these 18 (81.81%) were from HIV / AIDS patients. Conclusion: For all the above, diagnostic surveillance is important in this type of extrapulmonary infection, both for M tuberculosis and for other non-tuberculous species and to be able to start specific treatment early, avoiding the spread of the infection, since it can have fatal consequences on all in patients with some type of immunosuppression, such as HIV/AIDS. If a patient maintains a prolonged fever, with lymphadenopathy, without respiratory symptoms and does not respond to antibiotic treatment, it is necessary to consider this type of infection(AU)


Subject(s)
Humans , Early Diagnosis , Lymphadenopathy/diagnosis , Lymphadenitis/diagnosis , Epidemiology, Descriptive , Prospective Studies
2.
Rev. cuba. salud pública ; 47(3)sept. 2021.
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1409234

ABSTRACT

Introducción: Existen diferentes métodos de descontaminación de muestras pulmonares para el diagnóstico de micobacterias. El Programa Nacional de Control de Tuberculosis recomienda el método de Petroff modificado con solución salina, pero no existen evidencias documentadas que avalen este método. Objetivo: Evaluar el método de Petroff modificado con solución salina para el diagnóstico de micobacterias en el sistema Bact/Alert 3D. Métodos: Se realizó un estudio observacional analítico de pruebas diagnósticas utilizando 100 muestras pulmonares recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kourí, abril 2016 enero 2017. La muestra se dividió en 3 alícuotas y se descontaminaron mediante 3 métodos; luego se inocularon en los medios de cultivo sólido y líquido. Se compararon los resultados del cultivo en cuanto: tiempo de detección de crecimiento, tasa de contaminación, por ciento de positividad, además se calcularon indicadores de desempeño. Resultados: Al comparar el método Petroff modificado con solución salina con el Petroff modificado con solución fosfato en Löwenstein Jensen, el tiempo de detección de crecimiento, por ciento de positividad y la tasa de contaminación se comportaron de forma similar y la sensibilidad (93,75 por ciento), concordancia (96,47 por ciento) e índice de Youden (0,91) fueron elevadas. Al compararlo el Petroff modificado con solución salina con el N-Acetil-L-Cisteína, las variables no mostraron diferencias significativas y los Indicadores de Desempeño se comportaron por encima del 93 por ciento, para el medio sólido y líquido. Conclusiones: Los resultados avalan la continuidad del uso del Petroff modificado con solución salina como método de descontaminación de las muestras pulmonares en la red de laboratorios de Cuba y como alternativa en el pretratamiento de las muestras para el medio líquido (Bact/Alert 3D), además constituye un soporte para el Programa Nacional de Control de Tuberculosis(AU)


Introduction: There are different decontamination methods of pulmonary samples for the diagnosis of mycobacteria. The National Program for the Control of Tuberculosis recommends Petroff method modified with saline solution; but there are not documented evidences that endorse it. Objective: Assess Petroff method modified with saline solution for the diagnosis of mycobacteria in Bact / Alert 3D system. Methods: An observational analytic study of diagnostic tests was conducted; there were used 100 pulmonary samples received in the National Laboratory of References and Researches of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kourí Institute, from April 2016 to January 2017. The sample was divided in 3 aliquots and those were decontaminated using 3 methods; then, they were inoculated in the solid and liquid culture means. Cultures´ results were compared according to: growth's detection time, contamination rate, percent of positivity; in addition, performance indicators were calculated. Results: When comparing Petroff method modified with saline solution with Petroff method modified with phosphate solution in Löwenstein Jensen, the growth's detection time, the percent of positivity and the rate of contamination behaved similarly, and sensitivity (93,75percent), concordance (96,47percent) and Youden´s index (0,91) were high. When the Petroff method modified with saline solution was compared with N-Acetil-L- Cisteina, the variables did not show significative differences and the behaviour indicators were over 93percent for the solid and liquid mean. Conclusions: The results endorse the continuity of the use of Petroff method modified with saline solution as a decontamination method of pulmonary samples in the network of Cuban laboratories and as alternative to the pre-treatment of the samples for the liquid mean (Bact/Alert 3D); it also constitutes a support for the National Program for the Control of Tuberculosis(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Acetylcysteine , Tuberculosis, Pulmonary/prevention & control , Decontamination/methods , Observational Study
3.
Rev. cuba. med. trop ; 72(3): e585, sept.-dic. 2020. tab
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1156547

ABSTRACT

La pandemia actual provocada por el coronavirus SARS-CoV-2 ha alcanzado límites insospechados al inicio de 2020, afectando seriamente los sistemas de salud de muchos países de todos los continentes.1 La Organización Mundial de la Salud (OMS) y la Unión International contra la Tuberculosis y Enfermedades Respiratorias (La Unión) han expresado recientemente su gran preocupación por el impacto de la COVID-19 en la lucha contra la tuberculosis (TB) en el mundo, sobre todo en los países de más alta carga de la enfermedad y de recursos económicos limitados.2,3 Cuba es uno de los países con más baja carga de la enfermedad en la región de Las Américas 4) y trabaja fuertemente para ser uno de los primeros territorios en eliminar la TB, como problema de salud pública, antes de 2035.5 Para ello, se ha preparado un Plan Estratégico Nacional, basado en la Iniciativa Mundial de Fin de la TB,6 en el cual se establecen sus objetivos, metas, estrategias y prioridades para alcanzar este hito. En este plan, de manera general, se plantea: la prevención y atención integrada de la TB centrada en las personas afectadas, compromiso político, protección social y cobertura universal del diagnóstico y el tratamiento oportuno de la TB, y la investigación operativa e implementación de iniciativas y herramientas innovadoras para la prevención y el control de la TB. En Cuba, se confirmaron los primeros casos infectados con SARS CoV-2 el 11 de marzo de 20207,8 y desde entonces se activó su Plan de Acción Nacional contra Epidemias para establecer medidas destinadas a contrarrestar la enfermedad y proteger la salud de la población8) Con la implementación del Plan de Control y Prevención de la COVID -19 se definieron tres fases epidemiológicas: etapa 1: pre-epidémica, etapa 2: transmisión local limitada, y etapa 3: epidémica. Hasta este momento, Cuba se encuentra en la etapa 2. Desde la segunda quincena de marzo, el presidente de la República, Miguel Díaz-Canel Bermúdez, informó de varias medidas para evitar el movimiento de los ciudadanos, facilitar el distanciamiento social, mejorar la higiene de la población y reforzar el trabajo en los hospitales y centros de aislamiento destinados la atención de los casos confirmados, contactos de estos o personas sospechosas de portar el virus SARS CoV-2.8 Para fortalecer el trabajo en las unidades de salud, y a la vez minimizar el riesgo de infección con el nuevo coronavirus, el Ministerio de Salud Pública (Minsap) de Cuba adoptó varias acciones importantes con su personal: Colocar a los trabajadores de salud > 60 años y con enfermedades con comorbilidad para COVID-19 en actividades de teletrabajo, trabajo a distancia o exento de trabajo (cobrando 100 % de salario el primer mes y después a 60 %). Movilizar a los trabajadores de salud disponibles en tareas concretas de enfrentamiento directo contra COVID-19 en unidades de salud tradicionales y otras designadas para ello. Ubicar a otros trabajadores de la salud no relacionados directamente en la lucha contra la COVID-19 en apoyo de tareas complementarias (higienización, suministro de recursos médicos y alimentarios y otros, en unidades de salud). El resto de las personas del sector salud se acogieron a las modalidades de trabajo actuales, antes mencionadas (teletrabajo, trabajo a distancia o exento de trabajo). Las medidas y acciones tomadas por el Minsap y por el Gobierno de la República de Cuba han permitido el tránsito por un escenario más favorable con cifras muy bajas de pacientes graves y letalidad por debajo de la media de la región de Las Américas y del mundo.9 Sin embargo, el enfrentamiento a esta emergencia mundial pudiera provocar un debilitamiento del resto de los programas de salud. Al revisar los datos del Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), hemos notado en estos últimos meses una disminución del número de muestras clínicas enviadas (con relación al año anterior) por las unidades de salud de la provincia de La Habana, y también de las provincias occidentales que mandan esputos para el diagnóstico rápido de la TB por PCR en tiempo real (prueba Xpert MTB/RIF) de personas de los principales grupos vulnerables de la enfermedad (Tabla 1). Adicionalmente, también ha habido una reducción considerable de la cantidad remitida de aislados de Mycobacterium tuberculosis para la vigilancia de la resistencia a los fármacos antituberculosos (Tabla 2) y de las láminas enviadas para el control de la calidad de la...(AU)


Subject(s)
Humans , Coronavirus Infections/epidemiology , Tuberculosis/prevention & control , Cuba
4.
Salud(i)ciencia (Impresa) ; 24(1/2): 12-18, jun. 2020. graf.
Article in Spanish | BINACIS, LILACS | ID: biblio-1129948

ABSTRACT

El aumento de las infecciones por micobacterias ambientales u oportunistas (MAO) coincide mundialmente con el declive de la infección tuberculosa e incremento de la infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). El presente trabajo es un estudio retrospectivo realizado en el Laboratorio Nacional de Referencia-Investigaciones de Tuberculosis/Micobacterias/Lepra (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias), del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), La Habana, Cuba, durante el período enero 2014-diciembre 2018. El objetivo de nuestro estudio fue conocer la variabilidad de especies aisladas para establecer un referente actualizado sobre las infecciones causadas por estas. En este trabajo se clasificaron-identificaron 413 cepas procedentes de pacientes sintomáticos; 162 (39.22%) eran aislamientos de pacientes con VIH/sida atendidos en nuestro Hospital Nacional de Referencia a Atención al paciente VIH/sida (IPK), y el resto (n = 251 [60.77%]), procedentes de pacientes inmunocompetentes, incluyendo aislamientos recibidos de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología, y Microbiología (CPHEM). Las muestras fueron analizadas con las técnicas convencionales establecidas: las pulmonares fueron descontaminadas por el método de Petroff modificado; las extrapulmonares, por el método del ácido sulfúrico al 4%; el cultivo se realizó en medio de Löwenstein-Jensen modificado. Posteriormente se realizó la clasificación-identificación de especies según el esquema fenotípico-bioquímico establecido. Las especies con mayor porcentaje de aislamiento pertenecieron a los Grupos III y IV, complejo Mycobacterium avium-intracellulare (34.14%) y complejo M. fortuitum (20.82%), respectivamente. Estos resultados permitirán conocer la prevalencia de estas especies en nuestro país, reafirmando la importancia diagnóstica de estos microorganismos para aplicar tratamiento específico, sobre todo en pacientes con factores de riesgo, en quienes es más probable la diseminación de la infección.


The increase in infections by environmental or opportunistic mycobacteria (MAO) coincides worldwide with the decline in tuberculosis infection and an increase in infection by the human immunodeficiency virus (HIV). The present work is a retrospective study carried out at the National Reference Laboratory-Tuberculosis/Mycobacterial/Leprosy Research (LNRI-TB / Leprosy / Mycobacteria), of the Pedro Kourí Institute of Tropical Medicine (IPK), La Habana, Cuba, during the period January 2014-December 2018. The objective of our study was to know the variability of isolated species to establish an updated reference on the infections caused by MAO. In this study, 413 strains from symptomatic patients were classified and identified; 162 (39.22%) were isolates from patients with HIV/AIDS treated at our National Hospital of Reference for Attention to HIV/AIDS patients (IPK), and the remaining (n=251 [60.77%]), from immunocompetent patients, including isolates received from the Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology, and Microbiology (CPHEM). The samples were analyzed with the established conventional techniques: the lung samples were decontaminated by the modified Petroff method; the extrapulmonary, by the 4% sulfuric acid method; the culture was carried out in modified Löwenstein-Jensen medium. Subsequently, the classification-identification of species was carried out according to the established phenotypic-biochemical scheme. The species with the highest percentage of isolation belonged to Groups III and IV, Mycobacterium avium-intracellulare complex (34.14%), and M. fortuitum complex (20.82%), respectively. These results will allow us to know the prevalence of these species in our country, emphasizing the diagnostic importance of these microorganisms and thus apply a specific treatment, especially in patients with risk factors, in whom the spread of the infection is more likely


Subject(s)
Tuberculosis , Mycobacterium avium Complex , Risk Factors , Acquired Immunodeficiency Syndrome , HIV , Mycobacterium , Mycobacterium avium
6.
Rev. cuba. med. trop ; 68(2): 148-156, may.-ago. 2016. tab
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-844987

ABSTRACT

Introducción: la contaminación cruzada por Mycobacterium tuberculosis (Mtb) en el laboratorio es más común de lo que se piensa. Objetivo: confirmar un posible episodio de contaminación cruzada por Mtb en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias del Instituto Pedro Kouri. Métodos: se realizó un estudio descriptivo y retrospectivo de los indicadores de calidad del cultivo del 3er trimestre de 2014. Se observó un incremento de cultivos positivos a Mtb con codificaciones bajas, durante un día de trabajo. Se encontraron 10 aislamientos de 19 muestras procesadas: ocho con sospecha de contaminación cruzada y dos aislamientos pertenecientes a uno de los pacientes involucrados y que tuvo un cultivo positivo procesado en una fecha diferente. Las muestras se procesaron según lo establecido por el Programa Nacional de Control de la Tuberculosis de Cuba. A los cultivos positivos se les realizó la tipificación con oligonucleótidos espaciadores Spoligotyping. Resultados: el aislamiento de la muestra 1 435 (paciente 1) fue un patrón único al no aparecer en la base de datos internacional SITVIT2. En los cultivos de las muestras 1 438 y 1 439 (paciente 2) se identificó el linaje Beijing (tipo 1). En los siete cultivos restantes (pacientes del 3 al 7) se identificó el linaje S tipo 71; los cultivos posteriores de estos pacientes fueron negativos a excepción del paciente 5 (muestra 1 561), en el que se aisló Mtb con el mismo patrón genético. Conclusiones: los resultados de la genotipificación permitieron confirmar los cultivos positivos contaminados e inferir una posible fuente de contaminación durante ese día de trabajo. También resalta la importancia de identificar eventos de contaminación cruzada, pues puede implicar un mal manejo clínico de los pacientes, así como el uso innecesario de un tratamiento largo y costoso, además de influir en el análisis e interpretación de los resultados desde el punto de vista epidemiológico(AU)


Introduction: cross contamination of Mycobacterium tuberculosis in the laboratory is more common than thought. Objective: to confirm a possible event of cross-contamination of Mycobacterium tuberculosis in the National Reference Laboratory of Tuberculosis, Leprosy and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute. Methods: a descriptive and retrospective study of quality indicators of culture for the third quarter of 2014 was conducted. An increased Mycobacterium tuberculosis-positive culture with low encodings was observed during a working day. Ten isolates of 19 processed samples were found: eight suspected cross-contamination and two isolates from one of the patients involved and had a positive culture processed on a different date. The samples were processed as established by the National Program for Tuberculosis Control in Cuba .Positive cultures were typed by using oligonucleotide spacers Spoligotyping. Results: the isolation of the sample 1 435 (patient 1) showed a unique pattern that does not appear in the international database SITVIT2. In the culturing of 1 438 and 1 439 samples (patient 2), the Beijing lineage (type 1) was identified. In the remaining seven cultures (patients 3 through 7), the lineage S type 71 was identified. The subsequent cultures of the samples taken from these patients were negative except for patient 5 (sample 1 561) in whom Mtb was isolated with the same genetic pattern. Conclusions: the results of genotyping allowed confirming the contaminated positive cultures and inferring a possible source of contamination during that workday. It also highlights the importance of identifying cross-contamination events, because it may involve poor clinical management of patients and thus the unnecessary use of a long and costly treatment, in addition to influencing the analysis and interpretation of the results from the epidemiological viewpoint(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , /methods , Mycobacterium tuberculosis , Epidemiology, Descriptive , Retrospective Studies , Quality Indicators, Health Care/standards , Cuba , Public Health Laboratory Services
8.
Rev. cuba. med. trop ; 67(3): 0-0, dic. 2015. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: lil-777074

ABSTRACT

Introducción: el género Mycobacterium provoca infecciones pulmonares y extrapulmonares, dentro de estas últimas las localizaciones más frecuentes son; sistema nervioso linfático, central, circulatorio, genitourinario, gastrointestinal, tejido osteoarticular, y la piel. Objetivo: realizar las caracterizaciones etiológica de infecciones extra pulmonares producidas por el género Mycobacterium, destacar su importancia diagnóstica tanto en pacientes VIH- como VIH/sida. Métodos: se realiza un estudio descriptivo-prospectivo de corte transversal realizado de enero 2012 a mayo 2014. Durante este período se recibió un total de 825 muestras, 232 de pacientes VIH- y 593 de pacientes con VIH/sida. Las muestras que lo requerían se le aplicaron descontaminación cultivo, se utilizó el método de ácido sulfúrico al 4 por ciento, para el cultivo se usó el medio de Löwenstein-Jensen. Resultados: de las 825 muestras extra pulmonares en 29 (3,5 por ciento) se obtuvo cultivo positivo,14 (48,3 por ciento) con aislamiento de Mycobacterium tuberculosis (11 VIH+ y 3 VIH-), y 15 (51,7 por ciento) con aislamiento de otras especies micobacterianas (12 VIH+ y 3 VIH-), Mycobacterium avium-intracellulare, y Mycobacterium malmoense fueron las especies más aisladas. Conclusión: por todo lo anterior expuesto se recomienda mantener la vigilancia diagnóstica en este tipo de infección extra pulmonar, en especial en pacientes con sida, pues en muchos casos pueden tener fatales consecuencias por su diagnóstico tardío(AU)


Subject(s)
Humans , Lung Diseases, Fungal/diagnosis , Mycobacterium Infections/complications , Mycobacterium Infections/diagnosis , Specimen Handling/methods , Epidemiology, Descriptive , Cross-Sectional Studies , Prospective Studies
9.
Rev. cuba. med. trop ; 67(1): 41-49, ene.-abr. 2015. tab
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: lil-761012

ABSTRACT

Introducción: en las últimas décadas se han desarrollado nuevas herramientas para disminuir el tiempo de diagnóstico de las infecciones por Mycobacterium tuberculosis. Objetivo: introducir nuevas herramientas para la identificación de M. tuberculosis y comparar los resultados con el cultivo en Löwenstein Jensen. Métodos: se estudiaron 1 368 muestras recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, de agosto 2010 - agosto 2014. Las muestras después de procesadas fueron inoculadas en paralelo en Löwenstein Jensen y en BacT ALERT. Los resultados se ana­lizaron y compararon con relación al total de aislamientos, tiempo de detección de crecimiento y tasa de contaminación, se calcularon además los indicadores de desempeño del BacT ALERT. Resultados: por Bact/ ALERT se identificó Mycobacterium tuberculosis en 126 (98,5 por ciento) muestras y 116 (88,5 por ciento) por el Löwenstein Jensen. El tiempo de detección de crecimiento de Mycobacterium tuberculosis por el BacT/ ALERT fue de 16,6 días, dos veces menor que el obtenido por el Löwenstein Jensen (35,5 días). La tasa de contaminación por el Bact/ ALERT y Löwenstein Jensen fue de 11 por ciento y 7,8 por ciento, respectivamente. La sensibilidad, especificidad e índice de Youden fue de 99,1 por ciento, 99,0 por ciento y 0,98, respectivamente; y el índice de validez del 99 por ciento. Conclusiones: el sistema Bact/ ALERT resultó un método útil porque acortó significativamente el tiempo de diagnóstico de la tuberculosis permitiendo comenzar el tratamiento de forma oportuna, sobre todo en pacientes con baciloscopia negativa. El uso combinado del Löwenstein Jensen y medio líquido aseguró la recuperación del total de cepas de M. tuberculosis(AU)


Background: in recent decades, new tools have been developed to decrease the time of diagnosis of infections with Mycobacterium tuberculosis. Objective: to introduce the new tools for identification of M. tuberculosis and compare the results with culture in Löwenstein Jensen. Methods: 1 368 samples received at the National Tuberculosis Reference Laboratory of the IPK from August 2010 to August 2014. After samples processed were inoculated in parallel on Löwenstein Jensen and BacT ALERT. The results obtained are analyzed and compared with respect to the total isolates, time detection of growth and contamination rate, the performance indicators of BacT ALERT also calculated. Results: by Bact / ALERT were identified Mycobacterium tuberculosis in 126 (98.5 percent) samples and 116 (88.5 percent) by Löwenstein Jensen. The time detection of growth of Mycobacterium tuberculosis by BacT / ALERT was 16.6 days, two times lower than that obtained by the Löwenstein Jensen (35.5 days). The contamination rate by Bact / ALERT and Löwenstein Jensen was 11 percent and 7.8 percent, respectively. The sensitivity, specificity and Youden index was 99.1 percent, 99.0 percent and 0.98, respectively; and the validity index was 99 percent. Conclusions: bact / ALERT system proved a useful method because it significantly shortened the time of tuberculosis diagnosis and start allowing treatment in a timely manner, especially in smear-negative patients. The combined use of liquid medium and Löwenstein Jensen assured recovery of all strains of Mycobacterium tuberculosis(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Tuberculosis/diagnosis , Tuberculosis/transmission , Anti-Infective Agents/therapeutic use , Tuberculosis/microbiology , Epidemiology, Descriptive , Cross-Sectional Studies
10.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 31(4): 788-792, oct.-dic. 2014. ilus
Article in Spanish | LILACS, LIPECS, INS-PERU | ID: lil-733266

ABSTRACT

Se presenta un caso de coinfección por Mycobacterium malmoense y Mycobacterium tuberculosis en un paciente cubano con síndrome de inmunodeficiencia adquirida (sida), que producía enfermedad respiratoria y hepática respectivamente. Los cultivos realizados a partir de las muestras de esputo demostraron la presencia de una cepa micobacteriana no pigmentada de crecimiento lento perteneciente al grupo III de Runyon e identificada como Mycobacterium malmoense. A partir de los cultivos del tejido hepático extraído laparoscópicamente se aisló una cepa posteriormente identificada como Mycobacterium tuberculosis. El estudio anatomopatológico confirmó el diagnóstico de tuberculosis, el paciente recibió tratamiento específico y evolucionó clínicamente bien. Se reporta un caso infrecuente de coinfección por Mycobacterium, el cual describe el primer reporte de tuberculosis hepática en una paciente con sida en Cuba.


A case is presented of coinfection with Mycobacterium malmoense and Mycobacterium tuberculosis in a Cuban patient with AIDS which produced respiratory and liver disease respectively. Cultures done from sputum samples showed the presence of a non-pigmented, slow growing mycobacterial strain belonging to Runyon group III and identified as Mycobacterium malmoense. From cultures of liver tissue removed laparoscopically, a strain was isolated and subsequently identified as Mycobacterium tuberculosis. Anatomapathologic examination confirmed the diagnosis of tuberculosis, the patient received specific treatment and had a favorable clinical course. This report of a rare case of coinfection of Mycobacterium describes the first report of hepatic tuberculosis in a patient with AIDS in Cuba.


Subject(s)
Humans , Male , Adult , Mycobacterium Infections , Mycobacterium tuberculosis , Acquired Immunodeficiency Syndrome , Cuba
11.
Salud(i)ciencia (Impresa) ; 21(1): 40-44, Nov.2014. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-790940

ABSTRACT

Las infecciones provocadas por micobacterias atípicas, micobacterias no tuberculosas y más recientemente denominadas micobacterias ambientales u oportunistas, en los últimos tiempos desempeñan un papel preponderante en el diagnóstico clínico. Estas especies se relacionan generalmente con estados de inmuno depresión del paciente. En este trabajo se estudiaron 136 cepas aisladas de pacientes con sintomatología específica tanto pulmonar como extrapulmonar, incluidos aquellos infectados por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), éstas fueron estudiadas e identificadas en el Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones de Tuberculosis, Lepra y Micobacterias, durante el período de enero de 2011 a diciembre de 2012. Es importante destacar que el 72.79% de los aislamientos eran procedentes de pacientes VIH positivos. El total de las cepas aisladas fue analizado según la clasificación establecida por Runyon; los grupos encontrados con mayor frecuencia fueron el III y el IV; por especie, las de mayor porcentaje de aislamiento fueron las del complejo Mycobacterium avium-intracellulare, Mycobacterium malmoense, Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium chelonae, respectivamente. Estos estudios son de gran importancia diagnóstica en los laboratorios de micobacteriología, pues de esta forma se puede llegar a conocer cuáles son las especies micobacterianas predominantes en la población,y lograr establecer una vigilancia sobre este tipo de infecciones, particularmente en pacientes inmunodeficientes, los que pueden ser origen de una peligrosa diseminación de la enfermedad...


Subject(s)
Humans , HIV , Opportunistic Infections , Nontuberculous Mycobacteria , Mycobacterium avium Complex , Infections
12.
Rev. cuba. hig. epidemiol ; 50(1): 29-36, ene.-abr. 2012.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-628708

ABSTRACT

Introducción: El laboratorio es un componente crítico en el diagnóstico, tratamiento, prevención y control de la tuberculosis. Objetivo: Analizar el comportamiento del control de calidad de la baciloscopia en los laboratorios de referencia provinciales de tuberculosis de Cuba, mediante el método de rechequeo de láminas a ciegas. Métodos: Se realizó el control de calidad, por el método de rechequeo de láminas, a 5 424 láminas de esputo BAAR recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, procedentes de los laboratorios de tuberculosis de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Cuba, desde el año 2007 hasta 2009. Resultados: Se identificaron 54 errores de lectura; de ellos, 20 falsos positivos, 13 falsos negativos y 21 errores de codificación. La sensibilidad, especificidad y concordancia mostraron valores de 84,7, 99,6 y 99,4 porciento, respectivamente. La concordancia entre el Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí y los laboratorios provinciales de tuberculosis evaluados fue de 99,4 porciento (Índice de kappa 0,8105) y la discordancia fue de solo el 0,6 pociento. Conclusiones: Los resultados sugieren una adecuada calidad del personal de los laboratorios provinciales para realizar el control de calidad de la BK de esputo BAAR. Se recomienda continuar con las visitas a los laboratorios de la red para detectar las deficiencias e implementar las medidas correctivas oportunas con el fin de seguir mejorando la calidad del diagnóstico de la baciloscopia y así eliminar la tuberculosis como problema de salud en Cuba


Introduction: The laboratory is a critical component in the diagnosis, treatment, prevention and control of tuberculosis. Objective: To analyze the behavior of quality control of bacilloscopy in provincial reference laboratories of Cuba, by the re-checkup of blind plates. Methods: The quality control was carried out by re-checkup method of plates at 5 424 plates of BAAR sputum received in the National Reference Laboratory of Tuberculosis and Mycobacteria of the Pedro Kourí Institute, originating in the laboratories of tuberculosis of Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology and Microbiology of Cuba from 2007 to 2009. Results: Fifty four reading errors were identified; from them 20 false-positive, 13 false-negatives and 21 coding error. The sensitivity, specificity and concordance showed values of 84.7, 99.6 and 99.4 percent, respectively. The concordance between the NRLTB PKI and the provincial tuberculosis laboratories assessed was of 99.4 percent (Kappa rate 0.8105) and the discordance was only of 0.6 percent. Conclusions: Results suggest an appropriate staff quality of the provincial laboratories staff to carry out the quality control of BAAR sputum BK. It is recommended to continue with visits to network laboratories to detect the deficiencies and to implement appropriate corrective measures to go on with the diagnosis quality of BK and so to eliminate the TB as a health problem in Cuba


Subject(s)
Humans , Diagnostic Errors/prevention & control , Sputum/microbiology , False Negative Reactions , False Positive Reactions , Specimen Handling/standards , Laboratory Test/methods , Quality Control , Tuberculosis, Pulmonary/diagnosis
13.
Rev. cuba. salud pública ; 38(2): 214-229, 2012.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-659845

ABSTRACT

Se describe la participación del Laboratorio Nacional de Referencia e Investigaciones en Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, en la organización del recurso bacteriológico para el diagnóstico y la búsqueda de casos, fundamentalmente en la atención primaria de salud, en apoyo al Programa Nacional de Control de la Tuberculosis. Se hace referencia a las funciones y principales actividades científicas de este Laboratorio Nacional, Centro Colaborador OPS/OMS, como cabecera de los laboratorios de la red de diagnóstico de la tuberculosis en el país. La introducción y aplicación de nuevas tecnologías de avanzada permite contar con valiosas herramientas para dar respuesta a los diferentes retos que plantean la tuberculosis y las micobacteriosis en la actualidad. Con la ejecución de un proyecto del fondo mundial de lucha contra el sida, la tuberculosis y la malaria, se ha fortalecido la red de diagnóstico, lo que debe contribuir, en un futuro cercano, a la eliminación de la tuberculosis como problema de salud en Cuba


The participation of the National Laboratory of Reference and Research on Tuberculosis and Mycobacteria of Pedro Kouri Institute of Tropical Medicine in the organization of the bacteriological resources for the diagnosis and screening of cases in the primary health care, in support of the national program for control of tuberculosis, was described in this paper. Reference was made to the functions and main scientific activities of this laboratory, which is a PAHO/WHO collaborating center at the forefront of the tuberculosis diagnosis laboratory network in the country. The introduction and the implementation of state-of-the-art technologies have allowed valuable tools to be used to meet several challenges posed by tuberculosis and mycobacteria nowadays. Thanks to the implementation of a World Fund against AIDS, tuberculosis and malaria project, the diagnosis network has strengthened, which must contribute to the elimination of tuberculosis as a health problem in Cuba in the near future


Subject(s)
Diagnostic Techniques and Procedures , Reference Standards , Tuberculosis/diagnosis
14.
Arch. venez. farmacol. ter ; 28(2): 51-53, jul. 2009. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-630358

ABSTRACT

El cultivo bacteriológico, es la prueba de oro para el diagnóstico definitivo de la tuberculosis (TB). La finalidad del control de calidad es mejorar continuamente la eficiencia y el uso del cultivo como una alternativa de diagnóstico y monitoreo, asegurando que la información generada por el laboratorio sea confiable y exacta. Método: Se calcularon los indicadores de calidad (IC) a 5799 cultivos de las muestras de esputo de pacientes con TB pulmonar confirmada bacteriológicamente, recibidas en los laboratorios de diagnóstico de TB de la provincia Las Tunas, 4721 del laboratorio del Centro Provincial de Higiene y Epidemiología (CPHE) y 1078 del laboratorio del Centro Municipal de Higiene y Epidemiología (CMHE) de Puerto Padre, en el período de octubre del 2003 a septiembre del 2005. Resultados: En el CPHE la tasa de contaminación (TC), el aporte del cultivo al diagnóstico (ACD) y el % baciloscopía positiva con cultivo negativo fue de 4.3%, 34.8% y 6.3% respectivamente. En el laboratorio del CMHE la TC presentó un valor de 7.6% y el resto de los indicadores fue de 0%. Conclusiones y recomendaciones: Los indicadores de calidad del cultivo en el laboratorio del CPHE de Las Tunas, exceptuando el % BK (+) CU (-), presentaron valores aceptables para un buen desempeño del laboratorio; en el laboratorio del CMHE de Puerto Padre los valores de los IC, a excepción del % BK (+) CU (-), fueron superiores establecidos por las normas internacionales. Recomendamos incorporar el cálculo de los IC a la red nacional de laboratorios que realizan cultivo, para conocer y evaluar los resultados del trabajo e incorporar la evaluación de la sensibilidad del medio de cultivo para mejorar el rendimiento y la calidad del diagnóstico de la TB


The bacteriological culture, it is the golden test for the definitive diagnosis of the tuberculosis (TB). The purpose of the quality control is improve the efficiency and use of culture like an alternative of diagnosis and monitoring, and assuring that the information generated by the laboratory are reliable and exact. Method: The quality indicators (QI) were calculated in 5799 sputum samples, from patients with pulmonary TB confirmed by bacteriological culture, received in the TB diagnosis laboratories from Las Tunas province, 4721 from TB Laboratory of the Hygiene and Epidemiology Provincial Center (HEPC) and 1078 from TB Laboratory of the Hygiene and Epidemiology Municipal Center (HEMC) of the Puerto Padre municipality, from October 2003 to September 2005. Results: In the HEPC the contamination rate (CR), the culture contribution to the diagnosis (CCD) and the percent of positive baciloscopy with negative culture (% BK+ CU -) was 4.3%, 34.8% and 6.3% respectively. In the laboratory of the HEMC the CR was 7.6% and the rest of the indicators were 0%. Conclusions and recommendations: The QI of culture in the HEPC laboratory from Las Tunas municipality, excepting the % BK (+) CU (-) presented acceptable values for a good performance, in the HEMC laboratory from Puerto Padre municipality, the IC values, to exception of the % BK (+) CU (-), were superiors to the established for the international norms. We recommended incorporate the calculation of QI in the national network of laboratories culture, in order to improve the yield and quality of TB diagnosis


Subject(s)
Female , Sputum/chemistry , Mycobacterium Infections , Tuberculosis/complications , Pharmacology, Clinical
15.
Arch. venez. farmacol. ter ; 27(2): 110-113, 2008. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-517108

ABSTRACT

El control de calidad de la baciloscopía (BK), es un sistema diseñado para mejorar la habilidad, eficiencia y el uso de la microscopía, como opción de diagnóstico y monitoreo, asegurando que la información generada por el mismo, sea exacta, fiable y reproducible. El objetivo del estudio fue evaluar los indicadores de calidad de la BK en los laboratorios de diagnóstico de tuberculosis de los Centros Provinciales de Higiene y Epidemiología de Cuba. Se realizó el control de calidad a 2054 láminas en el periodo enero – diciembre del 2006, según lo establecido en el Manual de Procedimientos del Programa Nacional de Control de Tuberculosis. De las láminas evaluadas, 269 (13.1 por ciento) presentaron codificaciones altas, 81 (3,9 por ciento) codificaciones bajas y 1704 (83 por ciento) fueron negativas. La tasa de error para todos falsos positivos fue de 1,1 por ciento; no se identificaron resultados falsos negativos. El índice de kappa general obtenido fue de 0,9949. La sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo y negativo presentaron valores superiores al 99 por ciento. Estos resultados sugieren la calidad del personal que realiza la BK de tuberculosis en los laboratorios provinciales y recomendamos no descuidar las continuas supervisiones y mantener un programa de entrenamiento constante de los técnicos para continuar mejorando la calidad del diagnóstico baciloscópico en Cuba.


Subject(s)
Clinical Laboratory Techniques , Quality Control , Tuberculosis/classification , Tuberculosis/diagnosis , Tuberculosis/microbiology
16.
Rev. cuba. med. trop ; 59(3)sep.-dic. 2007.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-489448

ABSTRACT

El Programa Nacional de Control de la Tuberculosis (TB) en Cuba, establece realizar el control de calidad (CC) externo de la baciloscopia (BK) a 100 por ciento de las láminas positivas y a 10 por ciento de las negativas, enviadas de forma mensual por los laboratorios de la red de diagnóstico de TB a los centros de referencia provinciales y al Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis y Micobacterias del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (LNRTB IPK).


Subject(s)
Sputum/microbiology , Tuberculosis, Pulmonary/diagnosis
17.
Rev. cuba. med. trop ; 58(3)sept.-dic. 2006. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-478642

ABSTRACT

Se evaluó el diagnóstico de tuberculosis en los laboratorios de los Centros Provinciales de Higiene y Epidemiología de Cuba incluido el municipio especial Isla de la Juventud. Se realizó el control de calidad a 4 382 láminas en el período enero-diciembre de 2004, según lo establecido en el Manual de Procedimientos del Programa Nacional de Control de Tuberculosis. Mostraron buena calidad en la extensión y coloración de Zielh Neelsen 4 003 (91,35 por ciento) láminas. El coeficiente de concordancia global del Laboratorio Nacional de Referencia de Tuberculosis en relación con los laboratorios provinciales fue de 99,79 por ciento. La sensibilidad y especificidad presentaron valores superiores a 99 por ciento. Estos resultados sugieren la calidad del diagnóstico de la baciloscopia de tuberculosis en los laboratorios provinciales y señalan la necesidad de no descuidar las continuas supervisiones, el monitoreo y el reentrenamiento en la técnica de baciloscopia, que sientan las bases para la introducción de los métodos de rechequeo a ciegas y panel de láminas dirigidas a perfeccionar la calidad del diagnóstico de tuberculosis en Cuba.


Subject(s)
Humans , Quality Control , Tuberculosis
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